طراحی بیوانفورماتیکی و بهینه سازی پپتیدهای مهارکننده گیرنده تروپومایوزین کیناز B در رده سلولی U266
نویسندگان
چکیده مقاله:
زمینه: گیرنده تروپومایوزین کیناز (Tropomyosin Receptor Kinas B, TRK B ) یکی از پروتئین های سرطانزاست . هدف: مطالعه به منظور طراحی و بهینهسازی پپتیدهای مناسب جهت مهار TRK B انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه پایه در سال 1391 در دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد، پس از طراحی کتابخانه پپتیدی با روش sequence tolerance و بهینهسازی انرژی پپتیدهای طراحی شده با روش backrub در بسته نرمافزاری Rossseta 3.3 ، پپتیدهای دارای حداکثر پایداری، براساس مقادیر backrub توسط نرمافزار R انتخاب شدند. ساختار سه بُعدی پپتیدها با استفاده از روش دینامیک مولکولی تعیین و میزان اتصال این پپتیدها توسط نرمافزار HADDOCK بررسی شد . پایدارترین پپتیدها سنتز و اثر سمی آنها با استفاده از آزمون MTT بر روی رده سلولی U266 مطالعه شد. یافتهها: پپتیدهای طراحی شده از لحاظ انرژی و ساختاری کاملاً پایدار بودند و تمایل بالایی برای اتصال به TRK B نشان دادند. پس از سنجش بقای سلول به کمک روش MTT ضمن تیمار رده سلولی U266 با این پپتیدها بعد از 24 ساعت، غلظت مهار سلولی 50 درصد ( IC 50% ) پپتیدهای یک و دو 2/350 و 5/199 نانومولار به دست آمد. نتیجهگیری: با توجه به یافتهها، به نظر میرسد مهار TRK B میتواند به توقف رشد در این رده سلولی سرطانی منجر شود .
منابع مشابه
طراحی بیوانفورماتیکی و بهینه سازی پپتیدهای مهارکننده گیرنده تروپومایوزین کیناز b در رده سلولی u۲۶۶
زمینه: گیرنده تروپومایوزین کیناز (tropomyosin receptor kinas b, trk b ) یکی از پروتئین های سرطانزاست . هدف: مطالعه به منظور طراحی و بهینهسازی پپتیدهای مناسب جهت مهار trk b انجام شد. مواد و روشها: این مطالعه پایه در سال 1391 در دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد، پس از طراحی کتابخانه پپتیدی با روش sequence tolerance و بهینهسازی انرژی پپتیدهای طراحی شده با روش backrub در بسته نرمافزاری ...
متن کاملتأثیر مهارکننده تلومراز بر روی بیان سایتوکاین‌های التهابی مؤثر در پاتوژنز میلوم‌مولتیپل، در رده سلولی میلومی U266
زمینه و هدف: تلومراز آنزیمی است که در 90-80% سرطان‌ها افزایش بیان دارد. فعالیت همزمان تلومراز و NF-Κb برای پیشرفت بسیاری از سرطان‌ها ضروری است. محققین در سال‌های اخیر به ارتباط تنگاتنگ تلومراز با فاکتور رونویسیNF-κB پی برده‌اند. با افزایش بیان تلومراز، افزایش قابل‌توجهی در بیان NF-κB و ژن‌های هدف، ازجملهIL-6 و TNFαمشاهده می‌شود. در سال‌های اخیر روش‌های متعددی جهت مهار تلومراز در سلولهای سرط...
متن کاملتاثیر سایتوتوکسیک مهارکننده PI3K در رده سلولی لوسمی پرومیلوسیتیک حاد
چکیده سابقه و هدف مسیر PI3K/Akt که در تنظیم رشد سلولی و تکثیر نقش مهمی ایفا میکند، تقریباً در 70%-50% بیماران APL فعالیت بالایی را نشان میدهد. مشخص شده است که در سلولهای لوسمیک این بدخیمی، فعالیت PI3K عمدتاً ناشی از افزایش بیان ایزوفرم p110δ میباشد. در این مطالعه بر آن شدیم تا اثر بخشی داروی Idelalisib را که یکی از مهمترین مهارکنندههای p110δمیباشد، در سلولهای NB4 مشتق از APL بررسی کنیم...
متن کاملاثر سایتوتوکسیک بازدارنده انتخابی آرورا کیناز B بر درصد زنده مانی و فعالیت متابولیکی رده سلولی لوسمی پرومیلوسیتیک انسانی
Background and Aim: A goal of modern cancer research is to reach targeted therapies with drugs having fewer side effects. AZD1152 is a highly specific inhibitor of Aurora Kinase B, which leads to the programmed cell death by different mechanisms. The aim of this study was to evaluate the effects of AZD1152 on viability and metabolic activity of NB4 cells (APL derived cell line). Materials and...
متن کاملبهینه سازی تراآلایی و بیان پایدار فاکتور9 انسانی در رده ی سلولی دروزوفیلا
با هدف دستیابی به کلون های پایدار از سلول های S2 بیان کننده فاکتور 9 انعقادی انسانی (S2-hFIX)، در این مطالعه تاثیر عوامل مختلف بر تراآلایی و بیان پروتئین نوترکیب در سامانه بیانی S2 قابل القاء ،با استفاده از یون فلزی به عنوان القاء کننده، مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از تراآلایی یک سازه بیان کننده EGFP تحت کنترل پروموتر متالوتیونین(pMT-EGFP) به سلولهای S2 با روش های لیپوفکشن و کلسیم فسفات، بررسی ن...
متن کاملطراحی بیوانفورماتیکی و بهینه سازی تولید آنزیم گلوکزاکسیداز نوترکیب بیان شده در مخمر یارروویا لیپولیتیکا
سابقه و هدف: آنزیم گلوکزاکسیداز کاربرد فراوانی در صنایع پزشکی، دارویی، غذایی، نساجی و محیطی دارد. بیان هترولوگ این آنزیم در میزبان های مخمری به دلیل برخی از محدودیت های تولید صنعتی این آنزیم توسط آسپرژیلوس نایجر بررسی شده است. این مطالعه با هدف بررسی ویژگی های بیوانفورماتیکی گلوکزاکسیداز در سویه نوترکیب مخمر یارروویا لیپولیتیکا Po1g-GOX و بهینه سازی شرایط تولید این آنز...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 17 شماره 5
صفحات 4- 9
تاریخ انتشار 2013-12
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023